Służby sanitarne nadzorują ujęcia wody na terenach dotkniętych powodzią, kontrolują też żywność dostarczaną powodzianom. Sanepid przygotował ulotki, które informują o zapobieganiu chorobom zakaźnym, a także o zachowaniu
bezpieczeństwa przy spożywaniu żywności w czasie powodzi.
Główny Inspektorat Sanitarny (GIS) zalecił służbom sanitarnym wzmożenie kontroli pod kątem zagrożeń skażeniami chemicznymi i mikrobiologicznymi wody i żywności, dostarczanym ludności na terenach zalanych.
Inspektorat zaleca też zabezpieczenie ujęć powierzchniowych wody przeznaczonej do celów komunalnych. Nadzór ma być sprawowany także nad sprzętem dowożącym wodę pitną dla powodzian i na potrzeby gospodarcze.
Szczególną kontrolą powinni zostać objęci stali nosiciele duru brzusznego. Konieczne jest dezynfekowanie szamb i dołów kloacznych, z których te osoby korzystały.
Nadzór sanitarny ma być także prowadzony nad cmentarzami, w przypadku ich zalania Sanepid podejmie działania przeciwepidemiczne.
Specjalnie przygotowane przez Sanepid ulotki trafiły do gmin dotkniętych żywiołem. Podkreśla się w nich, że aby uniknąć zakażenia zarazkami, które są przenoszone w wodzie należy odkazić wapnem chlorowanym zalane powodzią studnie i ujęcia wodne, przy użyciu chemicznych środków czyszczących należy także odkazić pomieszczenia mieszkalne i gospodarcze. Szczególnie należy zadbać o czystość toalet.
Wodę, która służy do picia, płukania owoców i warzyw czy nawet do mycia zębów należy zawsze gotować. Surowe produkty pochodzenia zwierzęcego oraz warzywa należy traktować jako zakażone i nie dopuszczać do ich zetknięcia z produktami gotowymi do spożycia.
Konieczne jest także częste i dokładne mycie rąk.
Na terenach objętych powodzią służby sanitarne prowadzą monitoring występowania chorób zakaźnych, a także zachorowań spowodowanych toksycznym działaniem środków chemicznych. Dane na bieżąco są przekazywanie do GIS.